2.1.1 原始數(shù)據(jù)格式要求

A.?Fastq格式

B.?Bcl格式，需要提供Samplesheet文件。

2.1.2 數(shù)據(jù)分析內(nèi)容

●基礎(chǔ)分析

1、基本質(zhì)控，包括數(shù)據(jù)量與質(zhì)量統(tǒng)計

2、產(chǎn)出統(tǒng)計及測序數(shù)據(jù)成分和質(zhì)量評估

3、去除接頭及污染序列，低質(zhì)量序列的處理

3、OUT分析

4、種屬分類與豐度分析

5、Alpha多樣性指數(shù)

6、Belta多樣性分析

7、多樣本物種比較(>=2個樣本)

8、基于OTU豐度的heatmap圖分析

9、基于OTU豐度的PCA、PCoA分析

10、UniFrac顯著性分析分析

11、基于OTU豐度的進化樹分析

●高級分析（定制）

12、RDA/CCA分析

13、腸型分析

14、LEfSe分析

15、Wilcoxon秩和檢驗

2.1.3 數(shù)據(jù)分析周期

基礎(chǔ)分析 ： 10-15工作日

高級分析 ： 10-15工作日(基礎(chǔ)分析后)?